Hallo Rina-Katha,
grundsaetzlich wuerde ich empfehlen, entweder suedlich oder noerdlich um Paraguay herumzufahren. Die Busverbindungen im Nordwesten von Paraguay (Gran Chaco) sind notorisch schlecht, und die Gegend ist sehr, sehr karg.
Fuer die Suedroute wurde sich eine Reise ueber Salta und den Salar de Uyuni anbieten, ggf. mit Abstecher nach Potosi. Die Nordroute fuehrt ueber das brasilianische Pantanal (Corumba) und dann mit dem Zug nach Bolivien rein. Beide Routen treffen sich in La Paz, von da ist es dann straightforward (Titicacasee-Cusco, am besten Puno-Cusco per Zug). Natuerlich gibt es auch noch andere (weitere) Wege, aber das ist es, was die meisten machen. Die Suedroute durch Argentinien ist einfacher und populaerer. In Argentinien sind Nachtbusse uebrigens kein Problem.
LG, Karoshi