Wir waren im 2011 in San Pedro und haben folgendes unternommen:
Nächtliche Tour zu einem privaten Astronomen mit Sternentour.
http://www.spaceobs.com/. Ich fand das sehr spannend und unser Guide hat das auch total gut gemacht.
Dann haben wir bei einem Veranstalter gleich 3 Touren auf einmal gebucht, da wir nur ein paar Tage vor Ort waren und so die Zeit nutzen wollten. Die Angebote sind alle ähnlich denke ich und die Veranstalter wechseln sicher auch. Wir hatten einen gesucht der im Lonely Planet als gut stand, den gabs nicht mehr. Wir haben dann bei Desert Adventure gebucht. Die Autos waren ok, die Guides auch. Da wir zu zweit waren, 3 Ausflüge auf einmal gebucht haben und bar bezahlt haben, ist uns auch ein Rabatt eingeräumt worden. Einfach fragen.
Valle de la Luna (der Sonnenuntergang war toll!)
Salar de Atacama y lagunas altiplanicas (ist, wenn du aus Bolivien kommst evtl. nicht mehr so spannend, bzw. willst Du Salar ja eh nicht mehr)
Geyser del Tatio (war "ganz nett")
Ob es auch reine "Wüstentouren" gibt, wie Du dir das vorstellst weiß ich nicht. Es ist halt sehr trocken, aber ich habe es nicht als so sandig empfunden, wie wenn man jetzt z.B. Bilder aus der Sahara sieht. Die Touri-Info ist da sicher hilfreich. Dort liegt auch eine Art Gästebuch, wo - zumindest damals - auch Kommentare zu den Tourenanbietern drin standen, so dass man ein Gefühl bekommen hat, zu wem man gehen kann oder auch besser nicht.
Wenn Du in San Pedro bist, wäre Calama sonst noch eine Möglichkeit um Touren zu machen. Wie dort die Touri-Infrastruktur ist, kann ich Dir nicht sagen. Wir sind nach Calama geflogen und auf dem Hinweg direkt weiter nach San Pedro und auf dem Rückweg abends angekommen und am nächsten Tag direkt mit dem Morgenflug zurück nach Santiago. Also der Einleitungssatz aus dem LP "Calama ist ein Drecksloch" nun ja, so ganz weit hergeholt ist der nicht. Deshalb würde ich aus dem Bauch raus sagen, dass Du in San Pedro vermutlich mehr Auswhl an Touren und -anbietern hast.