Zunächst mal sollte euch bewusst sein, dass ihr Chile/Argentinien im Winter bereisen werdet. Das werdet ihr in Santiago und Buenos Aires, vor allem aber im Hochland (Salta, etc.) merken. Nehmt warme Kleidung mit.
Wenn ihr nach Santiago fliegen wollt und von dort nach BA: Wieso fliegt ihr nicht gleich direkt nach BA und lasst Santiago aus? Nichts gegen Santiago, aber es ist wirklich kein Highlight von Südamerika und ihr habt nicht so viel Zeit. Von BA würde ich direkt per Nachtbus nach Iguazu. Von dort könntet ihr per Nachtbus weiter nach Salta, um euch den Arsch abzufrieren, von dort nach Tupiza, Bolivien, dann Uyuni, von dort ggfalls nach San Pedro, Chile oder einfach weiter Bolivien und Peru machen.
Eine alternative Route: Flug nach Rio de Janeiro, Flug nach Iguazu, von dort nach Bolivien, Uyuni, San Pedro (ist aber nach Uyuni ziemlich antiklimatisch), weiter mit Bolivien- und Peruprogramm. Wenn BA unbedingt mit muss: Rio, dann der Küste entlang über Uruguay nach BA, von dort Nachtbus nach Iguazu, von dort dann irgendwie weiter.
Rosario und Cordoba: Wäre mir nicht bewusst, dass es dort irgendwas besonders Interessantes gibt.